大豆中的胰蛋白胨酶抑制劑是絲氨酸蛋白胨酶抑制劑的一部分，它可以和胰腺分泌的絲氨酸蛋白酶系發(fā)生反應(yīng)，胰蛋白胨酶抑制劑與靶酶相互作用，通常如酶與底物之間的相互作用一樣，屬于互補型作用機理。兩者反應(yīng)時，抑制劑暴露在外的活動中心與靶酶的活動中心通過氫鍵相連接，形成穩(wěn)定的共價型復(fù)合物，從而導(dǎo)致酶活動中心的閉鎖，使靶酶的活性喪失，與通常的酶催化反應(yīng)相比，蛋白胨酶與抑制劑之間反應(yīng)的米氏常數(shù)很低，故蛋白酶與抑制劑的親和力大，二者可以迅速結(jié)合形成復(fù)合物。形成一種類似于牛肉浸膏的物質(zhì)。

    與一般酶的底物不同，抑制劑與酶結(jié)合后其活動中心的肽鏈并不裂解或裂解速度極慢。因此，該復(fù)合物雖然可以分解成游離的酶和變性或未變性的抑制劑，但解離速度非常緩慢。